Na klasikárskej trati, ktorá viedla zo Zakopaného do Koscieliska a merala 155 km, dokázal v špurte trojčlennej skupiny zdolať Rusa Pavla Sivakova a Austrálčana Jaia Hindleyho.
Člen tímu Jumbo-Visma sa vďaka triumfu vo štvrtkovej etape dostal aj do čela celkovej klasifikácie. Pred Sivakovom má náskok iba o bonifikačné štyri sekundy.
Výsledky 6. etapy (Zakopané – Koscielisko, 155 km): 1. Jonas Vingegaard (Dán./Jumbo-Visma) 4:07:13 h, 2. Pavel Sivakov (Rus./Ineos), 3. Jai Hindley (Austr./Sunweb) obaja rovnaký čas ako víťaz, 4. Sergio Andrés Higuita (Kol./Education First) +8 s, 5. Rafal Majka (Poľ./Bora-Hansgrohe), 6. Pierre-Roger Latour (Fr./AG2R La Mondiale), 7. Davide Formolo (Tal./Bora-Hansgrohe), 8. Tao Geoghegan Hart (V. Brit/Ineos), 9. Chris Hamilton (Austr./Sunweb), 10. Diego Ulissi (Tal./SAE Team Emirates) všetci +10
Poradie po 6. etape: 1. Vingegaard 22:13:57 h, 2. Sivakov +4 s, 3. Hindley (Austr./Sunweb +6, 4. Ulissi +17, 5. Higuita +18 s, 6. Latour +19, 7. Formolo, 8. Hamilton, 9. Majka, 10. James Knox (V. Brit./Deceunick-Quick Step) všetci +20